Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms