Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms