Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9PBE3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9PBE3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9PBE3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9PBE3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms