Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms