Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms