Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMX3A6NHT5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms