Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB1Q9Y5F3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB1Q9Y5F3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB1Q9Y5F3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB1Q9Y5F3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms