Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFG3L2Q9Y4W6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFG3L2Q9Y4W6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AFG3L2Q9Y4W6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFG3L2Q9Y4W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms