Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
RAPGEF2Q9Y4G8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
RAPGEF2Q9Y4G8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RAPGEF2Q9Y4G8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
RAPGEF2Q9Y4G8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms