Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSUH2Q9Y2M2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSUH2Q9Y2M2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms