Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2BQ9UQN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2BQ9UQN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP2BQ9UQN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms