Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC3Q9UQE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC3Q9UQE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC3Q9UQE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC3Q9UQE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC3Q9UQE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC3Q9UQE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC3Q9UQE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC3Q9UQE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC3Q9UQE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC3Q9UQE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms