Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM33Q9UPN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM33Q9UPN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms