Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAF8Q9UPN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF8Q9UPN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAF8Q9UPN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAF8Q9UPN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.6 ms