Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX6Q9UNH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX6Q9UNH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms