Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLEC4EQ9ULY5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLEC4EQ9ULY5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLEC4EQ9ULY5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLEC4EQ9ULY5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLEC4EQ9ULY5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC4EQ9ULY5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms