Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT6Q9ULM6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT6Q9ULM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms