Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PNMA3Q9UL41 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA3Q9UL41 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA3Q9UL41 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA3Q9UL41 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms