Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP3Q9UKI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms