Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRTO4Q9UKD2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRTO4Q9UKD2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms