Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF223Q9UK11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF223Q9UK11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms