Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C3orf18Q9UK00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf18Q9UK00 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms