Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBD1Q9UJT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBD1Q9UJT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms