Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL3Q9UH77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL3Q9UH77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL3Q9UH77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms