Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA9Q9UGM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA9Q9UGM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA9Q9UGM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms