Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9A2Q9UBY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A2Q9UBY0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A2Q9UBY0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC9A2Q9UBY0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9A2Q9UBY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms