Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN10Q9UBB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
ATXN10Q9UBB4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN10Q9UBB4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms