Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms