Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9Q9P0T7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9Q9P0T7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms