Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA13Q9P0J0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA13Q9P0J0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms