Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYOFQ9NZM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYOFQ9NZM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYOFQ9NZM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYOFQ9NZM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms