Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL39Q9NYK5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRPL39Q9NYK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms