Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VNN3Q9NY84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VNN3Q9NY84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms