Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOR4AQ9NXH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOR4AQ9NXH8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOR4AQ9NXH8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms