Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED17Q9NVC6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED17Q9NVC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms