Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM100Q9NV29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM100Q9NV29 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM100Q9NV29 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms