Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF3Q9NUQ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms