Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC3Q9NUD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC3Q9NUD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC3Q9NUD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms