Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPPQ9NTK1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPPQ9NTK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPPQ9NTK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPPQ9NTK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEPPQ9NTK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPPQ9NTK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms