Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC4Q9NSK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC4Q9NSK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC4Q9NSK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms