Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A11Q9NSA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A11Q9NSA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC22A11Q9NSA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms