Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TM7SF3Q9NS93 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM7SF3Q9NS93 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms