Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPORSQ9NS56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPORSQ9NS56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPORSQ9NS56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPORSQ9NS56 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms