Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERINC1Q9NRX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERINC1Q9NRX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERINC1Q9NRX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms