Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF3Q9NR81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms