Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDLIM7Q9NR12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDLIM7Q9NR12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM7Q9NR12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms