Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 L3MBTL4-205ENST00000580162 457 ntTSL 313.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 L3MBTL4-206ENST00000581231 568 ntTSL 510.01□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 519.86■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-212ENST00000458632 635 ntTSL 310.09□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 39.13□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.06□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 39.8
EXOSC5Q9NQT4 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.231e-15■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 511.84□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 25.24□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 39.6
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-208ENST00000469606 4447 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-210ENST00000612340 560 ntTSL 54.47□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-206ENST00000461212 820 ntTSL 22.48□□□□□ -2.012e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 INTS7-209ENST00000475798 795 ntTSL 52.05□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 39.5
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-210ENST00000451940 662 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-9■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.83□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 26.14□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-209ENST00000526100 1600 ntTSL 24.1□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HBS1L-210ENST00000527005 2224 ntTSL 1 (best)3.71□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 39.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 TMEM38B-204ENST00000435034 721 ntTSL 34.83□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 TMEM38B-205ENST00000451560 451 ntTSL 34.42□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 GOLGA1-205ENST00000485337 935 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 GOLGA1-204ENST00000475407 4107 ntTSL 57.28□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 39.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-216ENST00000550632 728 ntTSL 312.73□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 39.1
EXOSC5Q9NQT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 39.1
EXOSC5Q9NQT4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 39.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.046e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-206ENST00000483591 892 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.366e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-204ENST00000473388 1569 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.436e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-207ENST00000483954 744 ntTSL 34.71□□□□□ -1.666e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 ATXN1-209ENST00000495178 853 ntTSL 1 (best)2.38□□□□□ -2.036e-12■■■■■ 39
EXOSC5Q9NQT4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 38.9
EXOSC5Q9NQT4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 38.9
EXOSC5Q9NQT4 DEK-205ENST00000507591 739 ntTSL 25.69□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 38.9
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 59.89□□□□□ -0.839e-10■■■■■ 38.8
EXOSC5Q9NQT4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 38.7
EXOSC5Q9NQT4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 38.7
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 38.7
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)5.03□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 38.7
EXOSC5Q9NQT4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 38.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 38.6
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EXOSC5Q9NQT4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.935e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 ZFAND3-204ENST00000440482 821 ntTSL 310.54□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 520.58■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 519.02■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 38.6
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 28.85□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 38.5
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EXOSC5Q9NQT4 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 47.69□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 TRIO-221ENST00000513206 7995 ntTSL 514.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 TRIO-218ENST00000512070 8907 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 TRIO-222ENST00000515144 7455 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 TRIO-213ENST00000509354 801 ntTSL 26.17□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 AL390879.2-202ENST00000431464 646 ntTSL 214.01□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.566e-7■■■■■ 38.5
EXOSC5Q9NQT4 DNAAF5-204ENST00000438961 579 ntTSL 416.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 516.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.66■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.11□□□□□ -1.119e-7■■■■■ 38.4
EXOSC5Q9NQT4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.549e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.499e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 520.87■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 38.3
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