Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX9Q9NQ69 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX9Q9NQ69 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX9Q9NQ69 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms