Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4BQ9NPR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4BQ9NPR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4BQ9NPR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205 ms