Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCFQ9NPI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCFQ9NPI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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